Els Hantavirus tenen forma oval a esfèrica (80-120 nm de diàmetre) . Són virus amb embolcall que en el seu interior presenten una nucleocàpsida helicoïdal.

El genoma dels Hantavirus és molt particular, és d’ARN monocatenari, circular i de polaritat negativa, dividit en tres segments d’ARN de diferent longitud: S, M’i L. El segment S (de l’anglés Small: «xicotet») codifica dos proteïnes: la proteïna N (proteïna per a la nucleocápside) i la NEP, una proteïna no estructural (Non-Estructural Protein) . El segment M (Mèdium: «medio») codifica per a tres proteïnes: G1, G2 i NEM (Non- Estructural molecule: «molècula no estructural») . El segment L (Large: «gran») està destinat per a l’ARN polimerasa.

Cada virió presenta tres nucleocàpsides; Esta constituïda pel genoma i la càpside. Cada virió conté tres nucleocàpsides formades per un dels segments de RNA i la proteïna N (S, M’o L) i la proteïna N. Serològicament, la proteïna N s’usa per a detectar les variants específiques de virus.

El embolcall viral té el seu origen a partir de la membrana plasmàtica de les cèl·lules infectades; presenta les proteïnes G1 y G2 que  intervenen en la adherència viral a la cèl·lula diana.

Estructura del Hantavirus